如何辨别巴西龟的性别？
首先，虽然巴西龟是变温动物，但是它们的性腺却是不受体温影响的，在冬季或者早春一样可以发育，所以“冷开水”的说法并不可取； 其次，巴西龟属于半水栖息的动物，平时活动于清水或浅水中，如果水深达不到身体一半，那么它们很可能因为呼吸困难而死亡（幼龟尤其这样）； 最后，判断巴西龟的性别，观察腹甲的形状是最准确的方法。 下图左为公龟腹甲，右为母龟腹甲 可以看到，公龟腹甲成“凹”形，母龟腹甲成“凸”形（幼年及成年雄龟也有可能是“凹”形的，但是繁殖季节的公龟一定是“凹”形）！这是由于公龟的肛门前部有一对生殖突起，因此排便时粪便由肛门向外排，而不是像母龟那样由泄殖孔排出。而生殖突起的形态不同也就导致了腹甲形状的不同。 还有一种比较取巧的方法，就是看尾巴，尾部的肛门附近如果有明显的突起，则是公龟（幼年及成年雄龟也可能没有明显突起）。
不过要注意的是，上述方法只能用于判断成年的巴西龟的性别，而对于幼龟则是效用不大。并且要注意的是，由于外界环境因素以及个体差异的原因，有的巴西龟即使已经成年，其性征也不一定非常明确，此时就可以通过观察其日常行为方式来分辨。如公龟经常霸占母龟的活动区域，而母龟则会避开公龟。
在肉眼状态下，一般成体（100克以上）巴西龟的性别判别是比较容易的，最常用的方法是根据巴西龟长有掌突（指、趾间具缘膜，趾间蹼不发达者，称为掌）。巴西龟的腹甲由9块硬甲骨构成，在龟腹部中央正中线两侧还各有一块可活动的“入气盖板”，这两块盖板可以上下活动，它对龟是至关重要的，当有敌害攻击龟的腹部时，它可将双侧的板向上活动锁住，使腹部得到保护，同时它也是巴西龟呼吸时最重要的活动区域。
在可活动的“入气盖板”的外侧面，巴西龟的雄性个体，可看到5个稍微突起的黑点，而雌性个体没有。有的书上说，雌龟也有，但不如雄龟明显。这一点，在饲养实践中是不存在的，成体以上的巴西龟，雌性，肯定没有的。这是性别最可靠的分辨方法，巴西龟的性别就是根据此判断的。
在通常情况下，雄性巴西龟（左）比雌性（右）身体要小些，头颈部也略显细些。头部、颈部的橙红色斑点在雄性个体上显得尤为醒目。而成年雄性巴西龟的最大特征是其尾巴更为粗大，且尾根部有一块“盾鳞”，上面有一个类似“逗号”的图案，这个“逗号”的开口方向是向着头部的，这一点，在判断成体性别时，也是至关重要的。因为，刚刚孵出的幼龟，尾部不粗，但也有一个这样的“逗号”，此时，它的性别尚未分化，如将此阶段的幼龟按成体的依据来判断性别，将会出现严重的偏差，给科研或生产造成不必要的损失。
