什么猫有蓝色眼睛？
首先，我们得确定一下题主问的“有什么”是什么意思——“是什么品种”“有多少品种”“哪一种比较多”还是“所有品种都有”呢？ 如果是第一种和第二种情况的话，那答案就很简单了——任何猫都可以是蓝眼睛。举个例子，我的加菲猫（异短）就是蓝色的眼睛。
但如果问的是第三种情况或者第四种，那么答案就不一定是显而易见的了。 因为颜色基因并不像性别基因那样有显性/隐性之分。所以，比如一个三色猫（黄、黑、蓝）会有一个基因型为YYRr的母猫，也会有一个基因型为yyrr的公猫；而如果一个两色猫（黄+白）则只有当母猫为YyRr的时候，才会出现蓝眼睛的概率。 所以如果根据遗传学来分析，理论上讲所有颜色组合都有可能出现。。。 不过这里需要指出的一点是，除了毛色外，纯合异质型的基因型在现实生活中是无法表现出来的。因为动物不会同时拥有两种纯合基因型。比如说一只小猫如果是黄色（c），黑色（b），蓝色（A），那它眼睛的颜色只能是黑，而不能是蓝。 如果出现其他颜色的眼睛，那必定是由于其中一种基因为杂合状态导致的。
例如： 一只双色猫(黄+白)，基因型可表现为yyRR或yyRr，那眼睛颜色可为棕色或橙色； 一只三花猫(黄、黑、蓝)，基因型可表现为yyrr或YyRr，那眼睛颜色可为蓝色或琥珀色~ 不过，由于现在能看到的猫咪眼睛颜色太多了，各种颜色混在一起，这就使得我们对猫咪眼睛颜色基因的研究变得复杂化了。 为了便于研究，人们选择了单纯由一对染色体重组导致眼睛颜色单一的例子进行研究。也就是Creighton大学实验室发现的黄-棕眼色突变例。这是位于猫眼睛颜色基因位点上的首个被确认的影响眼部颜色的突变。 这个突变会导致虹膜(ir)基因的第一个外显子缺失从而造成该基因的失活。
缺失的区域包含一个CAG三等位基因簇，这个三等位基因簇在正常眼睛颜色个体中为CCA，在棕色眼睛个体中为CCC，在一个罕见但确有存在的类型中是CTC。无论哪种形式，都不可能再编码氨基酸序列，因此都是无效的基因型。 虽然这是一个让人耳目一新的发现，但是由于缺乏足够的实验证据，这个理论仍然需要更多的试验去验证。